Генетика продолжительности жизни
Продолжительность жизни, т. е. способность поддерживать жизнеспособность организма длительное время, является комплексным количественным признаком, вносящим определяю- ший вклад в дарвиновскую приспособленность.
Раскрытие генетической структуры долгожительства — фундаментальная проблема эволюции онтогенеза, эволюционной генетики и молекуляр- 30 ной геронтологии. Среди множества факторов, ограничивающих продолжительность жизни, включая несчастные случаи, голод и насильственную гибель, только старение является внутренней причиной (Flatt, 2004; Vijg, Suh, 2005). Даже в благоприятных лабораторных условиях старение имеет место у подавляющего большинства животных. К сожалению, в эксперименте крайне трудно отделить биологический компонент продолжительности жизни от остальных (Poirier, Seroude, 2005).Старению можно дать такое рабочее определение: это потеря приспособленности, проявляющаяся после достижения максимума репродуктивной функции (Vijg, Suh, 2005). На популяционном уровне старение выражается в снижении способности давать потомство и в увеличении вероятности гибели.
Оно протекает с разными скоростями у разных видов животных, а это, по всей вероятности, указывает на то, что скорость старения определяется не только механическим износом (Partridge, Gems, 2002). Таким образом, старение — комплексный результат взаимодействия генов и среды, регулируемый стрессом, метаболическими факторами и репродукцией (Heininger, 2002), а также защитными системами на уровне клетки, ткани и организма. В отличие от продолжительности жизни, старение сложно оценить при помощи каких-либо простых критериев. Проявления его чрезвычайно сложны. Более того, многие из них могут быть частью патологий (Vijg, Suh,2005) .
Как правило, при поиске «геронтогенов» (так называемых генов старения и продолжительности жизни) у модельных объектов применяют фенотипический скрининг, который имеет целью выделение мутантных линий, характеризующихся свойствами, отражающими значительное изменение темпа старения.
Фенотипом, оцениваемым при таком скрининге, может быть либо сама продолжительность жизни, либо скорость функциональных нарушений, связанных со старением. Для ускорения темпов исследований могут быть оценены фенотипы стресс-ответа (устойчивость к теп - ловому и окислительному шоку), поскольку они часто связаны с увеличением продолжительности жизни (Poirier, Seroude, 2005). Функциональное старение модельных объектов можно измерить по возрастзависимой динамике поведенческих реакций. Жизнеспособность, измеренная через анализ стереотипных поведенческих актов, снижается с возрастом предсказуемым образом. Отбор мутантных особей, проявляющих задержку функционального старения, является альтернативой исследования продолжительности жизни (Poirier, Seroude, 2005).Взгляд на старение как на процесс пассивного функционального постепенного спада поддерживается исследованиями, показы-31 вающими, что с возрастом происходит снижение общего синтеза РНК и белка (Brack et al., 1996; Tahoe et al., 2004). Однако такой вывод справедлив лишь отчасти. Дело в том, что наибольший вклад в общий синтез макромолекул вносит герминативная ткань. Глобальное снижение биосинтеза в пострепродуктивном возрасте можно считать результатом уменьшения именно ее вклада. Современные молекулярные методы измерения активности определенных генов и белков в соматических тканях показали, что процесс старения является периодом воспроизводимых динамических изменений. Уровень экспрессии одних генов возрастает, тогда как других — снижается, часто демонстрируя довольно сложные временные паттерны. Причем эти изменения не являются стохастическим нарушением гомеостаза, поскольку стереотипно воспроизводятся от животного к животному (Helfand, Inouye, 2002). Выделяют два вида изменений экспрессии генов при старении: репарацию (компенсационный ответ с позитивным эффектом) и дерегуляцию (ответ с нейтральным или негативным эффектом) (T o- wer, 1996). Скоординированное изменение экспрессии генов начинается в ранней зрелости (Lu et al., 2004; McCarroll et al., 2004).
Однако геномная регуляция еще не доказывает того, что старение «запрограммировано» или эволюционно селективно. Напротив, изменение экспрессии может быть ответом на случайные повреждения (молекулярные ошибки, оксидативный стресс) или отражать побочные плейотропные эффекты адаптивных генов (Blalock et al., 2003).В идеале следует различать события, которые вызывают старение, и те, что вызывают болезни. Оба этих феномена снижают продолжительность жизни у модельных организмов. Старение — это угасание, которое наблюдается у подавляющего большинства особей популяции, тогда как конкретные возрастзависимые болезни случаются лишь у некоторых из них. Применительно к модельным объектам можно сказать, что механизм или ген, относящийся к старению, будет проявляться у большинства лабораторных линий дикого типа (Bitterman et al., 2003). Форма кривых выживания дрозофил, мышей и человека, представленная в безразмерных величинах, практически одинакова. Этот факт может свидетельствовать об универсальности фундаментального механизма старения (Акифьев и др., 1997). Таким образом, с определенными ограничениями (см. разд. 1.3) результаты, полученные на одном модельном объекте, могут использоваться для объяснения старения других.
Ранние исследования генетических основ старения базировались на использовании селективного скрещивания. В 60-х годах XX века на трех различных линиях Drosophila subobscura было показано увеличение продолжительности жизни в потомстве от ста- 32
рых долгоживущих родителей по сравнению с потомками от молодых родителей (Wattiaux, 1968). В 80-х годах удалось существенно увеличить среднюю продолжительность жизни как методом прямой селекции, так и косвенно — через отбор на позднюю репродукцию (Rose, Charlesworth, 1981; Luckinbill, Clare, 1985). Новый этап в исследованиях генетики продолжительности жизни начался в конце 80-х годов, когда были обнаружены мутации, способные продлевать жизнь. Долгоживущая линия и связанная с ней мутация были впервые выявлены у нематоды Caenorhabditis ele- gans.
Так был открыт ген age-1, кодирующий компонент фосфои- нозитол-3-киназного (PI3K) каскада. Затем было показано увеличение продолжительности жизни нематод в результате мутации гена daf-2 инсулиноподобного рецептора, контролирующего PI3K (Klass, Hirsh, 1976; Friedman, Johnson, 1988; Johnson, 1990; Kenyon et al., 1993). Дрожжи Saccharomyces cerevisiae стали следующим организмом, у которого были выявлены гены долгожительства (Kennedy et al., 1995). Как выяснилось позже, эти гены (например, Sir2) высококонсервативны в эволюции от дрожжей до человека (Fabrizio et al., 2005b). Наконец, в 1998 г. был открыт methuselah (mth) — первый «геронтоген» (ген, мутация в котором продлевает жизнь) у дрозофилы (Lin et al., 1998). В следующем году были опубликованы результаты, свидетельствующие об увеличении продолжительности жизни мышей с мутацией в гене p66 (Migliaccio et al., 1999). К данному моменту установлены десятки таких генов (см. ниже, табл. 5—8).Однако исследователи в области генетики продолжительности жизни столкнулись с целым рядом проблем (Felkai et al., 1999). Так, вовлечение того или иного гена в процесс старения можно изучить лишь на интактном организме и в связи с его продолжительностью жизни (такие эксперименты отличаются длительностью), а изменение функций многих генов ведет к уменьшению продолжительности жизни, однако это может быть не только результатом ускорения нормального старения, но и следствием независимой от старения специфичной патологии.
Решением последней проблемы может стать поиск генов, выключение которых продлевает жизнь. Гены долгожительства могут быть также идентифицированы путем измерения продолжительности жизни мутантов со сверхэкспрессией гена-кандидата (Butler et al., 2003). Однако и здесь мы можем затронуть не механизмы самого старения, а, например, уровень метаболизма (путем снижения температуры или ограничения подвижности) или плодовитость (Helfand, Rogina, 2003a, 2003b). Так или иначе, но мы не можем заплатить слишком высокую цену за долгожительство — пожертвовать качеством жизни (снижение репродукции или по- 33 движности).
Поэтому любое увеличение продолжительности жизни в эксперименте должно сопровождаться измерениями уровня метаболизма, физической активности и репродукции (Helfand, Rogina, 2003a, 2003b).Как часто бывает с признаками, связанными с приспособленностью, продолжительность жизни уменьшается при инбредной депрессии и увеличивается при гетерозисе, когда разные инбред- ные линии скрещиваются друг с другом. Ранние исследования Гонзалеса и Пирла на дрозофиле выявили, что фиксация рецессивных мутаций снижает продолжительность жизни (Gonzalez, 1923; Pearl et al., 1923). Впоследствии Кларк и Мейнард Смит показали, что скрещивания между инбредными линиями Drosophila subobscura приводят к удвоению средней продолжительности жизни (Clarke, Smith, 1955). А в 1995 г. Хьюджес выяснил, что инбридинг увеличивает прежде всего возрастзависимую (биологическую) компоненту смертности, т. е. скорость старения (Hughes, 1995).
Г енетическая основа инбредной депрессии неясна. Инбридинг оказывает негативное влияние практически на все признаки, такие как репродукция, развитие и выживаемость. Предположительно, это вызывается возросшей гомозиготностью, приводящей либо к экспрессии вредных рецессивных аллелей, либо к снижению вклада локусов, которые проявляют сверхдоминирование. Эффекты инбридинга на жизнеспособность можно подразделить на чрезмерно (например, летали) и умеренно (полулетали и квазинормали) вредные. Межлинейные различия эффектов у дрозофил указывают на то, что инбредная депрессия в каждом случае определяется различными генами. Вклад этих генов в старение зависит от частоты их аллелей в аутбредной популяции (Vermeulen, Bijlsma, 2004).
Генетические подходы обычно требуют унификации генетического фона, что увеличивает степень инбридинга и вероятность накопления вредных мутаций. Это приводит к искусственному снижению продолжительности жизни. Использование инбредных лабораторных линий в исследованиях старения является рискованным, поскольку фиксирование вредных аллелей в таких линиях может приводить к идентификации генов, продлевающих жизнь единственно путем ослабления инбредной депрессии, как генов долгожительства.
Генетические вмешательства могут просто «спасать» от вредных мутаций, не замедляя старения, а просто увеличивая продолжительность жизни до «нормальной» (Helfand, Rogina, 2003a, 2003b; Swindell, Bouzat, 2006; Toivonen et al., 2007).Существует вероятность, что известные эксперименты по селекции дрозофилы на увеличение продолжительность жизни у ла- 34
бораторных линий также могут просто восстанавливать исходную длительность жизни особей дикого типа. Как оказалось, продолжительности жизни мух из вновь пойманной популяции и особей линии, селектируемой на долгожительство в лабораторных условиях в течение 20 лет, существенно не отличаются, так же как и скорости старения, оцениваемые по величине угла наклона линии Гомпертца (Linnen et al., 2001).
Сравнение продолжительности жизни в поколениях инбред- ной и аутбредной линий дрозофил, подвергаемых хроническому облучению ионизирующей радиацией в малых дозах, показало, что облучение инбредной линии значительно увеличивает продолжительность жизни мух, начиная со второго облучаемого поколения. У аутбредной линии такого эффекта не наблюдали. Вероятно, это связано с радиационно-индуцированным подавлением инбредной депрессии (Москалев, Зайнуллин, 2006).
Несмотря на существенное, иногда на 85 %, продление жизни у ряда мутантов дрозофилы (methuselah, InR, Chico, Sod), зачастую они живут не дольше линий, недавно отловленных в дикой природе (Spencer et al., 2003). Эксперименты с использованием инбредных линий очень распространены. Результаты известных исследований долгожительства у трансгенных дрозофил, сверх- экспрессирующих ген Cu,Zn-Sod, могут быть артефактом, поскольку генетический фон исходных линий сам по себе приводил к относительному укорочению их продолжительности жизни (Orr, Sohal, 2003). Сверхэкспрессия гена цитозольной Cu,Zn-SOD в долгоживущих линиях дрозофил не продлевает жизнь (Trifunovic et al., 2005). Знаменитый «геронтоген» дрозофилы Indy (I’m not dead yet), кодирующий транспортный белок промежуточных компонентов цикла Кребса и якобы увеличивающий продолжительность жизни вдвое, также оказался артефактом. Причины этого артефакта — высокоинбредный генетический фон и зараженность внутриклеточным паразитом Wolbachia (Toivonen et al., 2007).
С другой стороны, использование только аутбредного фона тоже чревато проблемами — влияние невыравненного генетического фона может привести к ложным выводам. Одним из вариантов устранения проблемы является тестирование генетического вмешательства в разном генетическом окружении, включая другие инбредные или аутбредные линии (Helfand, Rogina, 2003a, 2003b; Toivonen et al., 2007). Еще одним способом решения проблемы генетического фона является использование модифицированных индуцибельных генов (содержащих регуляторные последовательности, активирующие экспрессию гена в ответ на внешнее воздействие — изменение температуры, добавление антибиотика и т. п.), поскольку в этом случае генетический фон идентичен, а различия обусловлены присутствием или отсутствием индуцирующего агента. При этом мы исключаем также нежелательную активизацию мутации на ранних стадиях развития, так как она может обусловить снижение продолжительности жизни не за счет ускорения старения (процесса, протекающего у взрослой особи), а в силу повреждений на ранних стадиях онтогенеза, либо вовсе быть леталью (Helfand, Rogina, 2003a, 2003b).
Как следует из исследований, выполненных на организмах в ряду от дрожжей до человека, продолжительность жизни имеет выраженный генетический компонент (Vijg, Suh, 2005). Его вклад включает аддитивную и неаддитивную составляющие генетической дисперсии (меры изменчивости) наследуемости, достигающие от 10 до 35 % (Finch, 1998; Flatt, 2004).
Поиск генов, вовлеченных в процесс старения, на генетически управляемых модельных организмах, таких как дрожжи, нематоды, дрозофилы и мыши, показал, что старение регулируется специфическими генами, и позволил проанализировать механизмы этого влияния, включая физиологические изменения на уровне организма, трансдукцию сигналов и регуляцию генов. Сходство фенотипов мутаций ортологичных генов у разных модельных видов демонстрирует, что подобные дефекты могут нарушать регуляторные системы, контролирующие старение и у высших организмов (Guarente, Kenyon, 2000). В то же время становится очевидным, что организмы не запрограммированы на старение, однако имеют программу продолжительности жизни, опирающуюся на активность систем самоподдержания и стресс-ответа (Vijg, Suh, 2005).
Многие механизмы старения могут быть идентичны у различных видов, благодаря тому что все эукариоты функционально схожи между собой (Bitterman et al., 2003). Тем не менее стоит различать частные («приватные») и общие («публичные») «гены старения» (Martin et al., 1996). «Приватные» гены проявляются при случайных герминативных мутациях, которые нейтральны в раннем возрасте, но проявляют вредные свойства в старости. У человека, например, они обусловливают некоторые возрастзависи- мые заболевания, такие как наследственные формы болезней Альцгеймера и Хантингтона. Сюда относятся и видоспецифичные «гены старения». Количество различных локусов таких генов, вероятно, очень велико, но мутации в них являются редкими. Общих (для всех особей вида и для разных видов) «генов старения», напротив, относительно мало. К ним можно отнести p53, участвующий в предотвращении рака через индукцию клеточного старения в делящихся тканях или апоптоза в сердце и в мозгу (Vijg, Suh, 2005). '
Изложенные в предыдущем разделе эволюционные теории старения предполагают наличие не менее трех классов «геронтогенов».
1. Согласно теории отработанной сомы, старение вызывается накоплением соматических повреждений, которым противостоят системы соматического поддержания, такие как антиоксидантная защита, репарация ДНК и белков. Таким образом, данная теория постулирует существование генов обеспечения долгожительства (longevity assurance genes), основная функция которых — поддержание выживания организма путем репарации соматических клеток. Потеря генов обеспечения долгожительства ускоряет проявление фенотипов старения и уменьшает продолжительность жизни (Vijg, Suh, 2005).
2. Теория антагонистической плейотропии постулирует наличие плейотропных «генов старения». Их задача — усиление репродуктивного успеха в молодости, несмотря на отсроченные негативные эффекты. Их мутации способны продлевать жизнь ценой снижения репродукции (Vijg, Suh, 2005).
3. Теория накопления мутаций постулирует наличие аллелей с небольшими вредными эффектами, не проявляющимися до старости и, таким образом, избегающими давления естественного отбора (Martin et al., 2007).
Ричард Миллер (Miller, 2001) феноменологически подразделил гены долгожительства на шесть больших групп.
1. Гены, вызывающие старение. Гипотетическая группа, возникшая в эволюции для преобразования молодого здорового индивидуума в старый и больной. Такие гены до сих пор обнаружены не были (Miller, 2001). Большинство геронтологов уверено, что аналогичных генов нет, поскольку они будут снижать репродуктивную пригодность и элиминироваться отбором (Гаврилов, Гаврилова, 1991; Butler et al., 2003). В изогенных популяциях при одинаковых внешнесредовых условиях одни особи умирают рано, тогда как другие характеризуются долгожительством. Такое наблюдение ставит под сомнение мнение о «генетической программе» старения (Rea et al., 2005). Другие свидетельства против запрограммированности старения приведены выше при рассмотрении соответствующей эволюционной теории.
2а. Гены, мутации в которых изменяют продолжительность жизни, увеличивая риск заболеваний в молодости или зрелости. Сюда относятся, например, врожденные нарушения функции сердца, диабет I типа. В естественных условиях они приводят к существенному снижению продолжительности жизни. По-видимому, многие из таких генов не способны пролить свет на причины старения (Miller, 2001). Однако в том случае, если они уско- 37 ряют множество аспектов старения, их можно отнести к истинным генам продолжительности жизни. Например, полное отсутствие митохондриального фермента супероксиддисмутазы 2 (Sod2) у мышей приводит к их гибели спустя месяц после рождения по причине кардиомиопатии. Является ли этот ген истинным геном продолжительности жизни, или просто вызывает несовместимый с жизнью дефект? Гетерозиготы по данной мутации характеризуются измененной функцией митохондрий и высокой чувствительностью кардиомиоцитов к апоптоз-индуцирующим агентам, что отмечается и при естественном старении (Butler et al., 2003).
2б. Мутантные гены, изменяющие продолжительность жизни, увеличивая риск раннего возникновения заболеваний, частично напоминающих своими симптомами старение. Классические примеры таких заболеваний — прогерии Вернера и Хатчинсона—Джилфорда (Miller, 2001). Некоторые симптомы данных заболеваний напоминают естественное старение, хотя другие важные признаки могут отсутствовать. Например, мутации в гене заболевания Хатчинсона—Джилфорда приводят к преждевременному развитию сердечно-сосудистой патологии, однако у таких больных не развивается другого характерного признака старения — нейродегенерации (Butler et al., 2003).
3. Гены, влияющие на возрастзависимые патологии. Их очень много. Это гены, мутации в которых приводят к болезни Альцгеймера, атеросклерозу, раку груди, дегенерации желтого пятна, диабету II типа, облысению, саркопении, старению иммунной системы. Такие гены с возрастзависимым проявлением были предсказаны эволюционными теориями старения (Miller, 2001). Данные локусы не регулируют весь процесс старения, а лишь отдельные его фенотипы. Так, у человека различия в этих генах обусловливают, как скоро конкретный индивидуум поседеет, облысеет, приобретет остеопороз, диабет или когнитивные нарушения (Butler et al., 2003).
4. Гены, мутации в которых увеличивают максимальную продолжительность жизни путем замедления процессов старе ния. Известны уже десятки генов, мутации в которых увеличи вают жизнь модельных объектов — нематод, дрозофил и мышей. Как правило, они замедляют старение. Например мутантные кар ликовые мыши rit1 характеризуются меньшей скоростью ста рения иммунной системы, суставов и соединительной ткани. Та ким образом, это гены не только долгожительства, но и антистаре ния. Поскольку долгоживущие мутанты не вытесняют носителей других аллелей в естественных и лабораторных популяциях, при обычных условиях они не несут особых селективных преиму ществ (Miller, 2001), хотя некоторые из них участвуют во внутри- 38
видовом варьировании продолжительности жизни (Flatt, 2004). Аллели, приводящие к долгожительству, присутствуют и у человека, но их труднее продемонстрировать у долгоживущего вида по сравнению с короткоживущими модельными животными. Примерами являются гены Propl и Ghr. Наилучший путь их идентификации — обнаружение таких генов сначала у беспозвоночных, подтвердждение их наличия у млекопитающих, а затем исследование их причастности к продолжительности жизни человека (Butler et al., 2003).
Генетические исследования беспозвоночных животных выявили множество механизмов, обусловливающих продолжительность жизни. Среди них инсулин/IGF-1-сигналинг, регулирующий транскрипционный фактор FOXO и TOR-путь, сиртуины, JNK-каскад, системы детоксификации свободных радикалов и вредных метаболитов, репарации белков и ДНК. Все эти механизмы присутствуют и у млекопитающих.
Важно знать при этом, обусловлен ли эффект инактивацией гена (loss of function), или индуцированным увеличением экспрессии (gain of function). Скрининг мутантов с потерей функции гена обычно приводит к обнаружению гипоморфных (частичная потеря функции) или нулевых, нокаутных (полная потеря функции), аллелей. Поиск генов с повышенной экспрессией, приводящей к увеличению продолжительности жизни, позволяет выявить гены, вовлеченные в процессы, не обнаруживаемые методом мутаций инактивации (Poirier, Seroude, 2005). Метод РНК-интерференции у нематоды позволил in vivo подавлять экспрессию генов, причем на интересующей нас стадии развития. С появлением данной методики количество открытых «геронтогенов» выросло в разы.
Для примера, у имаго нематод РНК-интерференция в одном из экспериментов позволила выявить 64 гена, увеличивающих продолжительность жизни на 10 % и более. Как оказалось, более 90 % из них высококонсервативно в эволюции от дрожжей до человека. Инактивация генов синтеза белка (генов факторов инициации трансляции и компонентов 40S-субъединицы рибосомы) сопровождалась наибольшим увеличением продолжительности жизни. Возможно, что снижение общего биосинтеза белка позволило перенаправить энергию на поддержание генома и адаптацию к стрессам. В условиях стресс-процесса в эндоплазматической сети также блокируется синтез белка. Инактивация оксидоредуктазы эндоплазматического ретикулума, кодируемой геном ero-1, продлевает жизнь на 32 %. Выключение генов сигналинга — еще один путь влияния на долгожительство. Потеря функции гена sem-5, негативно регулирующего RAS-MAP- и №3-трансдук- цию сигнала, привела к увеличению жизни на 24 %, так же как инактивация генов серин-треониновых протеинкиназ — tpa-1 и tag-181, а также sel-5 (гены ARK-семейства киназ) и pat-4 (ген ин- тегриноподобной киназы). Выключение рецептора инсулина daf-2 продлило жизнь на 79 %, как и ингибирование структурно сходных с daf-2 серпентиновых рецепторов str-49 и sre-25. Около 20 % обнаруженных генов участвуют в связывании и процессинге РНК (гены РНК-геликаз, факторов сплайсинга мРНК, рибонуклеаз, факторов полиаденилирования и метилирования РНК) и во взаимодействии с хроматином (гены регуляторов репликации ДНК и транскрипционных факторов), что может быть одной из причин наблюдаемого при старении изменения экспрессии генов (Curran, Ruvkun, 2007).
Мутации, изменяющие продолжительность жизни, очень часто рассматриваются как ускоряющие или замедляющие старение. Однако надо всегда помнить, что старение составляет основу лишь возрастзависимой компоненты смертности. Расчет параметров этой компоненты не обнаружил статистически значимого замедления старения у известных долгоживущих мутантов мышей GHRHR,IGF-1R,INSR,PROP1 и TRX либо его ускорения у мутано- тов ATM + TERC, BubR1, klotho, LMNA, PRDX1, p53, WRN + TERC или TOP3B. Зачастую изменения экспрессии в этих генах влияют на независимую от возраста компоненту смертности, определяющую здоровье. В то же время статистически значимое изменение скорости старения было отмечено у мышей с изменениями активности CEBP, MSRA, SHC1, гены гормона роста, GHR, PIT1 и PolgA (Magalhaes et al., 2005).
5. Естественно встречаемые аллели и аллельные комбинации, изменяющие продолжительность жизни. Как уже говорилось, наследуемость продолжительности жизни у мух, грызунов и людей обычно составляет 15—25 %. Она представляет собой долю дисперсии выживаемости, обусловленную генетическими факторами у особей с определенным генотипом в определенных условиях среды. Среди таких факторов следует отметить гены категории 3 (см. выше, с. 38), а также локусы количественных признаков (QTL), представляющие собой полиморфные гены, отвечающие за скорость старения внутри вида. QTL-анализ у нематод, дрозофил и мышей выявил десятки таких локусов, вовлеченных в естественный внутрипопуляционный полиморфизм продолжительности жизни (Miller, 2001 ; Flatt, 2004). Подобных локусов, вероятно, гораздо больше, однако аллели с очень малыми эффектами, действующими кумулятивно, остаются за рамками исследований (Butler et al., 2003). Выявление последних может стать реальностью при сочетании QTL-анализа с анализом экспрессии на микрочипах. Суть последнего метода заключается в изучении результатов гибридизации выделенной из клетки информационной РНК с нуклеотидными последовательностями, соответствующими интересующим нас генам. Данным способом можно количественно оценить активность тех или иных генов.
Исследование методом QTL-анализа позволяет ответить на важный вопрос: участвуют ли «геронтогены», выявленные методами молекулярной генетики, в естественной вариации продолжительности жизни в популяциях? Для перехода от карты QTL к конкретным генам необходимо определить как можно более малый участок. Затем применяется делеционный комплементационный анализ, который позволяет производить тонкое картирование рецессивных мутаций через использование хорошо изученных хромосомных делеций (Poirier, Seroude, 2005). Наиболее успешно метод был применен при изучении нематод и дрозофил (Shmookler et al., 2006).
У нематод методом QTL-анализа продолжительности жизни с использованием транспозонов в качестве маркеров были картированы локусы на хромосоме I (около локуса hP4), III (около stP127), IV (около stP44), V (около stP192, stP23 и stP6), а также на X-хромосоме (около stP129 и stP2). По признаку длительности жизни наблюдали значимое эпистатическое взаимодействие между локусами (stP128) (хромосома V) и (stP127) (хромосома III). На хромосоме I в QTL расположены гены rad-8, sod-2 и daf-16, влияющие на стрессоустойчивость. Остальные локусы близки «геронтогенам» akt-1 (хромосома V), akt-2 (X-хромосома), daf-12 (X-хромосома), clk-1, clk-2 и gro-1 (хромосома III). Активная копия sir-2 расположена возле локуса на хромосоме IV. Мутация spe-26, близко расположенная к sir-2, также увеличивает продолжительность жизни нематоды через ослабление сперматогенеза (Ayyadevara et al., 2003).
У дрозофилы исследования методом QTL-анализа выявили влияние на вариацию продолжительности жизни как доминирования этих локусов (аллельного взаимодействия для одного гена), так и эпистаза (взаимодействия аллелей разных генов). Было показано, что генетическая архитектура (т. е. количество генов и степень аллельных и генных взаимодействий) зависит от средо- вых условий, в которых существуют индивидуумы (Fox et al., 2004). Кроме того, большинство локусов количественных признаков у дрозофилы оказалось пол-специфичным (Wilson et al., 2006). В естественном варьировании продолжительности жизни могут принимать участие известные молекулярным геронтологам гены: локус алкоголь-дегидрогеназы (Adh), чья экспрессия также снижается с возрастом, и локус инсулиноподобного рецептора (InR), мутация в котором значительно продлевает жизнь. Как оказа-41
лось, дикие популяции дрозофилы имеют обширный полиморфизм по локусу InR. Кластеры генов белков теплового шока (hsp22— hsp28) и акцессорных белков (Acp26A и Acp70A, причем последний широко известен как половой пептид, ускоряющий старение самок), вовлеченных в репродукцию и регуляцию продолжительности жизни, также проявляют генетическую вариацию по продолжительности жизни (Flatt, 2004).
Метод QTL-анализа позволяет выявлять и новые гены продолжительности жизни. Нарпример, с его помощью была обнаружена причастность к старению генов ДОФА-декарбоксилазы (Ddc), Shuttle craft (stc) и ms(2)35ci. Ddc кодирует фермент, необходимый для выработки дофамина и серотонина в ЦНС и гиподерме. Ген stc является гомологом NF-X1 человека, кодирующего транскрипционный фактор РНК полимеразы II. Ген stc экспрессируется на эмбриональной, личиночной и взрослой стадиях жизни, прежде всего в мозгу и яичниках мух. О гене ms(2)35Ci известно только то, что это рецессивная аллель, в гомозиготе приводящая к стерильности самцов (De Luca et al., 2003; Poirier, Seroude, 2005).
Исследования полиморфизма и дивергенции по гену долгожительства mth на естественном популяционном уровне у трех видов дрозофилы (Drosophila melanogaster, D. simulans и D. yakuba) выявили нестереотипный паттерн аминокислотной дивергенции во внутри- и внеклеточном петлевых доменах белка Mth. Хотя эти данные не отвечают на вопрос, эволюционировал ли полиморфизм гена mth в ответ на отбор по продолжительности жизни, они показывают важность данного признака (mth) для организма (Schmidt et al. 2000).
Приведенные выше данные не являются сюрпризом: нет причин, по которым главные «геронтогены» не играли бы роли в более тонких аллельных вариантах при формировании продолжительности жизни в естественных популяциях. Однако они перекидывают необходимый мостик между молекулярной генетикой и эволюционной генетикой старения (Flatt, 2004).
6. Гены, обусловливающие долгожительство определенных видов. Почему животные, имеющие одинаковые размеры, например грызуны (крысы) и птицы (голуби), так различаются по продолжительности жизни (Butler et al., 2003)? Различия долгожительства имеют место и у относительно близких филетических групп. Паразитические нематоды млекопитающих и почвенные нематоды различаются по продолжительности жизни на 2 порядка. Среди грызунов суматранский гребенчатый дикобраз (27.75 лет) и имеющий размеры мыши голый слепыш (30 лет) живут гораздо дольше, чем близкие к ним виды. Люди живут дольше, чем шим- 42 панзе, павианы и лемуры. Гены, обеспечивающие замедленное старение, приобретают эволюционное преимущество, когда вид оказывается в благоприятных условиях, характеризующихся невысокими рисками гибели. В этом случае в результате отбора возникает вид, живущий вместо нескольких месяцев годы и даже десятилетия. Снижение рисков стало следствием таких ароморфо- зов, как приобретение способности к полету или средств пассивной защиты от хищников (панцырь, иглы), а также появления возможности обмена информацией для защиты от хищников и поиска пропитания либо возникновения географической изоляции от хищников. В новых условиях жизненный цикл, при котором образуется малое количество потомков за длительный период времени, получает преимущество по сравнению с имевшей место высокой ранней плодовитостью (Miller, 2001).
Какое количество генов необходимо для подобного перехода? Одни считают, что таких генов должно быть очень много: переход требует изменений, ведущих к отсрочке возникновения рака, дегенерации мышц, костей и печени, развития катаракты, а также повышению долговременной устойчивости к инфекциям. Основной проблемой данной модели является необходимость механизма координации и синхронизации этих процессов, поскольку долгожительство невозможно при отсутствии хотя бы одного из них (Miller, 2001). В таком случае, вероятно, большая часть генов долгожительства будет видоспецифична. Действительно, лишь около одной трети изменений возрастзависимой экспрессии генов коррелирует у мышей и человека, что может косвенно подтверждать данную точку зрения (Kyng et al., 2003).
Согласно другой модели, количество генов межвидовых различий долгожительства невелико. При этом они регулируют множество процессов развития и старения наподобие реостата, обусловливая темп дегенерации. Действительно, как ограничение калорийности пищи, так и отдельные мутации показывают, что широкий круг возрастзависимых процессов замедляется скоординированно (Miller, 2001). На наш взгляд, обе модели могут иметь право на существование. Несмотря на то что консервативных в эволюции генов стрессоустойчивости немного, они контролируют большое количество эффекторных генов. И те и другие способны влиять на продолжительность жизни.
С нашей точки зрения, данную феноменологическую классификацию необходимо дополнить еще двумя группами. Это гены со старение-ассоциированной экспрессией и генетические маркеры старения. Рассмотрим их.
7. Гены, экспрессия которых изменяется при старении.
Сюда следует отнести сотни генов, испытывающих возрастзави-
симое подавление или сверхактивацию. Эта новая область исследования требует дорогостоящих методов и мощных компьютерных средств обработки данных, поскольку речь идет об измерении активности десятков тысяч генов, а также о межвидовом сравнении экспрессии ортологичных генов.
С возрастом у дрожжей изменяется экспрессия 150 генов (т. е. 2.5 % генома) в 2 раза и более. При старении репрессируется ряд генов гликолиза, биосинтеза, сворачивания и деградации белка, тогда как несколько генов белков-транспортеров, напротив, сверхактивируется. Это приводит к снижению функции гликолиза, белкового обмена и стресс-ответа, но при этом к более активному использованию транспортной системы. Примечательно, что изменения экспрессии генов оксидативного стресс-ответа не происходит (Koc et al., 2004). В старых клетках также индуцируются гены глюконеогенеза, глиоксилатного цикла, метаболизма липидов и выработки гликогена, т. е. при клеточном старении происходит сдвиг к накоплению энергии (Lesur, CampbeП, 2004).
У дрозофилы в одном из экспериментов изучение возрастной динамики транскрипционной активности выявило 43 гена, активность которых с возрастом увеличивается, и 89 генов, экспрессия которых снижается. Снижение репродуктивной способности — один из фенотипов старения. В то же время сигналы из герминативной ткани влияют на длительность жизни. У дрозофилы показано снижение уровня РНК нескольких генов репродукции. Среди них 2 гена акцессорных белков семейства Acp. Белки Acp самца облегчают сохранение спермы в семяприемниках самки и стимулируют откладку яиц, однако уменьшают продолжительность ее жизни. Снижается экспрессия ряда предполагаемых генов гаметогенеза, в частности это касается гена белка из семейства септинов, участвующих в сперматогенезе. Метаболизм также является физиологическим процессом, претерпевающим изменение с возрастом: снижается транскрипция генов фруктозо-1,6-бифосфат-альдо- лазы, альдозо-3-эпимеразы, митохондриальной глицерол-3-фос- фат-дегидрогеназы. Все они контролируют превращения глюкозы и других сахаров, участвующих в гликолизе. Возрастзависимое снижение претерпевает и экспрессия гена фермента цикла три- карбоновых кислот — аконитазы. Наблюдали также уменьшение транскрипционных уровней цитохрома с и других ферментов окислительного фосфорилирования и электронотранспортной цепи митохондрий. Известным атрибутом старения является постепенное уменьшение устойчивости к различным стрессам, таким как тепловой шок и оксидативный стресс. С возрастом снижается транскрипция генов малого белка теплового шока (/кр2б) и алко- гольдегидрогеназы. Гены глутатион-5-трансферазы D1 и шапе- 44 рона 60, напротив, сверхэкспрессированы у старых особей (Zou et al., 2000).
Транскрипция около 23 % генома дрозофилы оказалась подвержена изменению при старении. Изначально предполагалось, что возрастзависимый паттерн экспрессии опосредуется транскрипционным подавлением через модификацию структуры и организации хромосом, что приводит к дерегуляции отдельных генов, нарушая гомеостаз организма. Однако у дрозофилы не было обнаружено свидетельств возрастзависимого изменения транскрипции в специфичных участках генома или повсеместной дерегуляции экспрессии генов (Pletcher et al., 2002). Использование технологии экспрессионных микрочипов для изучения специфичности транскрипционных ответов при старении в голове, тораксе и туловище дрозофилы привело к обнаружению как специфических, так и общих транскрипционых ответов в этих тканях в процессе старения. Около половины генов, снижающих свою экспрессию с возрастом, связано с репродукцией и относится к гонадам. Подавление митохондриальных генов, активация JNK-механизма и сверхактивация субъединиц протеосомы в грудном отделе тела стареющей мухи предполагают особую чувствительность мышц (метаболически высокоактивной ткани) к старению. Возрастзависимое нарушение генов синаптической передачи наблюдали в головном отделе мухи. Общим оказалось подавление активности многих генов, связанных с метаболизмом (генов окислительного фосфорилирования, цикла трикарбоновых кислот, выработки АТФ), тогда как гены синтеза пуринов сверхактивируются (Girardot et al., 2006). Сравнение паттернов экспрессии при старении нематод и дрозофил показало наличие общей возрастзависимой программы ген - ной экспрессии, запускающейся в ранней зрелости и модифицирующей репарацию ДНК, катаболизм, пептидолиз и клеточный транспорт. С возрастом репрессируются гены компонентов митохондриальной дыхательной цепи, АТФ-синтазного комплекса и цикла Кребса, а также АТФ-зависимого активного транспорта (включая транспорт ионов, питательных веществ и трансмиттеров). Это приводит к снижению экскреции и физиологической активности нейронов и мышц. Межвидовая корреляция экспрессии генов-ортологов составляла в среднем 0.16 и была достоверной. Таким образом, большинство возрастзависимых изменений видоспецифично, однако консервативный компонент составляет несколько сотен пар ортологов. Было показано, что консервативная в эволюции репрессия генов окислительного метаболизма и глобальные изменения паттерна экспрессии начинаются внезапно в ранней зрелости, задолго до начала функциональных нарушений. Данный паттерн у обоих организмов достоверно коррелирует с из- 45 менениями при тепловом и оксидативном стрессе. Это свидетельствует о том, что далеко не все изменения генной экспрессии при старении обусловлены накоплением повреждений. Нематоды имели, кроме того, и видоспецифичные особенности экспрессии генов при старении. У Caenorhabditis elegans репрессируются гены коллагенов и индуцируются гены гистонов, транспозаз, ДНК- и РНК-геликаз. Однако подобные изменения не отмечались у дрозофилы. Напротив, только при старении дрозофилы индуцируются гены цитохрома P450s, гликозилаз и пептидогликановых рецепторов (McCarroll et al., 2004).
Старение мышей связано со специфическими изменениями транскрипции генов в мускулатуре кишечника, коре головного мозга, мозжечке (Kayo et al., 2001). Старение мозга приводит к нарушению когнитивных и моторных способностей и является фактором риска для развития таких нейрологических заболеваний, как болезнь Альцгеймера и Паркинсона. При сравнении неокор- текса и мозжечка 5- и 30-месячных мышей было показано, что из 6347 изученных генов 63 (1 %) увеличили свою экспрессию в 1.7 раза в стареющем неокортексе и столько же — в 2 раза в стареющем мозжечке. Одну четверть из них составляли гены воспалительного ответа. Затем идут гены стресс-ответа, что согласуется с оксидативным стрессом и накоплением поврежденных белков (Lee C. et al., 2000). С использованием олигонуклеотидных массивов высокой плотности были проанализированы различия в экспрессии генов в гипоталамусе и коре молодых и старых мышей. Показано, что старение связано со снижением активности многих генов, вовлеченных в синаптическую передачу как в гипоталамусе, так и в кортексе. Уровень экспрессии гена синаптического ве- зикула-ассоциированного белка синаптотагмина I, вовлеченного в регуляцию высвобождения нейротрансмиттера, снижается более чем в 10 раз. Ген одного из белков, участвующих в экзоцито- зе синаптических везикул, также снижает свою экспрессию в несколько раз. Экспрессия гена цАМФ-зависимой протеинкиназы С снижается более чем в 3 раза. Она играет роль в синаптической пластичности и формировании следов памяти. Изменяется при старении экспрессия генов динамина и связанного с клатрином белка AP-2. Последние играют роль в росте нейронов и рециркуляции синаптических пузырьков. В ткани стареющего мозга также накапливается A—X-актин, сверхактивированный при болезни Альцгеймера (Jiang et al., 2001).
Сопоставление экспрессии транскриптов в гематопоэтических стволовых клетках и в переднем мозгу инбредных мышей с продолжительностью жизни (один из вариантов метода QTL-анализа) выявило, что экспрессия генов двух членов семейства глута-46
тион-Б-трансфераз — Gstm6 и Gsta3 в стволовых клетках и в мозгу коррелирует с продолжительностью жизни. Экспрессия генов стволовых клеток — Ube2s (ген фермента, коньюгирующего уби- квитин) и C5r1 (ген рецептора 1 компонента комплемента 5) также коррелирует с продолжительностью жизни (De Haan, Williams, 2004).
Анализ экспрессии генов клеток печени показал, что старение сопровождается изменением активности примерно 1 % генов. При этом 43 % из них активируются, а 57 % — подавляются. Большинство сверхактивированных генов связано с воспалением. Известны и другие патогенные белки, сверхактивированные в стареющей печени: бигликан — протеогликан внеклеточного матрикса печени, ответственный за фиброз; амилоид P — компонент сыворотки, гликопротеин амилоидных отложений, индуцирующий воспаление; цистатин B — ингибитор цистеиновых протеаз, участвующий в фиброзе. Одна четверть индуцированных при старении печени белков участвует в стрессответе, прежде всего оксидатив-ном. В репликации ДНК и регуляции клеточного цикла участвуют 23 % генов, чья экспрессия снижается при старении, причем большинство из них имеет негативное влияние на рост клетки и деление. При старении печени также снижается экспрессия генов метаболизма ксенобиотиков и гена аполипопротеина Е, секретируе-мого печенью и необходимого для выведения липопротеинов из крови. Нарушения в этом гене связаны с тяжелой формой атеросклероза у мышей. Снижение его экспрессии также может увеличивать количество атеросклеротических повреждений (Cao et al., 2001).
Всесторонний анализ экспрессии генов в сердце молодых (5 месяцев) и старых (30 месяцев) мышей показал, что старение связано с транскрипционными изменениями, способствующими сдвигу от метаболизма жиров к углеводному метаболизму и повышеннию экспрессии генов внеклеточного матрикса. Ряд генов, продукты которых (смутелин В, кальпонин 2, тропонины Т1 и С, клаудин 5, коннексин 43) выпоняют структурную функцию (функции компонентов внеклеточного матрикса, клеточной адгезии и роста), индуцируется в результате старения. Многократно увеличивается экспрессия гена главного компонента телец Леви a-синуклеина — маркера нейродегенерации при паркинсонизме. Это может свидетельствовать о нарушении симпатической иннервации сердца с возрастом. Окисление жирных кислот служит главным источником энергии для сердца. Происходит скоординированное снижение экспрессии генов, участвующих в транспорте жирных кислот в митохондрии, включая карнитин-О-пальмитоил- трансферазу 1, карнитин-ацетилтрансферазу, митохондриальную
карнитин/ацилкарнитинтранслоказу и карнитин-пальмитоилтран- сферазу 2. Некоторые подавляемые гены отвечают за липолиз: триацилглицеролгидролаза, мобилизующая триацилглицеролы из хранилищ; гормон-чувствительная липаза; ацил-КоА-тиоэстераза 1, модулирующая клеточный уровень лигандов комплекса жирных кислот с КоА. Старение также приводит к подавлению генов ß-окисления жирных кислот в митохондриях. Все это обусловливает нарушение функций митохондрий и снижение пальмито- ил-карнитинзависимого дыхания в митохондриях сердца стареющих крыс. Подавляется также экспрессия фруктозо-1,6-бифосфа- тазы 2 — ключевого фермента глюконеогенеза. Аллостерический фермент фосфофруктокиназа, контролирующая скорость гликолиза, напротив, индуцируется (Lee et al., 2002).
Идентифицировано 712 транскриптов, различным образом экспрессирующихся в молодых и старых скелетных мышцах мышей. Индивидуальный анализ генов показал, что транскрипционный профиль при старении мышц связан с повышенной активностью р53 (Edwards et al., 2007).
Около 4 % из 11 000 исследованных генов фронтального кор- текса человека претерпевают значительные изменения экспрессии с возрастом (в 1.5 раза и более). Существенно снижается экспрессия рецепторов нейротрансмиттеров, вовлеченных в синаптическую пластичность, а также генов, отвечающих за высвобождение синаптических пузырьков и их циркуляцию. Компоненты главных путей, трансдуцирующих сигнал и опосредующих длительное по- тенциирование и хранение памяти, также подавляются с возрастом. Главные кальций-связывающие белки, кальциевый насос и кальций-активируемый транскрипционный фактор, которые стимулируют нейрональное выживание, также значительно репрессированы. В стареющем кортексе снижается экспрессия генов, включенных в везикулярный/белковый транспорт, и подавлен синтез белков, которые стабилизируют микротрубочки и стимулируют аксональный транспорт. В то же время старение фронтального кортекса человека связано с увеличением экспрессии генов воспалительного и иммунного ответов, а также генов, которые опосредуют стресс-ответ и репарацию: это гены, участвующие в сворачивании белковой молекулы, в антиоксидантной защите и в гомеостазе ионов металлов (Lu et al., 2004).
В скелетной мышце человека при старении было обнаружено достоверное изменение экспрессии 250 генов. Среди них CYP26B1, который в возрасте 50 лет увеличивает экспрессию на 90 %. Он кодирует монооксигеназу, являющуюся членом семейства цитохрома P450 и метаболизирующую токсичные вещества. Напротив, ген LASS5 (гомолог гена долгожительства дрожжей lagl) снижает свою экспрессию на 25 %. Он участвует в церамидном сигнальном пути, опосредующем стресс-ответ и апоптоз. Г ены симпортеров и переносчиков хлорида необходимы для транспорта растворенных веществ при мышечном сокращении. Снижение уровня их экспрессии ведет к ослаблению тонуса мышц (Zahn et al., 2006).
Обнаружено 985 генов, изменяющих экспрессию в коровом веществе и центральной части почки человека с возрастом, причем профили экспрессии в этих двух частях органа сходны. При старении увеличивается экспрессия генов, связанных с формированием внеклеточного матрикса — базальной мембраны, участвующей в почечной фильтрации. Показано, что 7 сверхактивированных генов участвуют в поддержании эпителиальной полярности, 11 — кодируют рибосомальные белки, ряд генов кодирует транскрипционные факторы и сигнальные белки (Rodwell et al., 2004).
Таким образом, некоторые аспекты старения влияют только на специфические ткани, например, обусловливают постепенное ослабление мышц, снижение синаптической функции в мозгу и темпа фильтрации в почке. Другие проявления старения наблюдаются во всех клетках (накопление оксидативных повреждений в митохондриях, повреждения ДНК и белков). Поэтому неудивительно, что сравнение транскрипционного профиля стареющих мышц, почек и мозга привело к обнаружению общих свойств, соответствующих шести генетическим путям. Четыре группы генов с возрастом активируются (гены внеклеточного матрикса, регуляции роста клеток, активации комплемента, компонентов цитозольных рибосом), оставшиеся две — подавляются (гены хлоридного транспорта и субъединиц митохондриальной электронотранспортной цепи) (Zahn et al., 2006).
8. Генетические маркеры старения. На примере мышей были выявлены некоторые маркеры старения, предсказывающие оставшуюся продолжительность жизни и физиологический возраст. Среди них следует отметить изменение уровня СБ4-лимфоцитов и экспрессии генов клеточного цикла, таких как, например, pltfNK4a (Krishnamurthy et al., 2004; Zahn et al., 2006). Регулятор старения p16 экспрессируется многими (но не всеми) стареющими клетками, а также некоторыми опухолевыми клетками, особенно потерявшими фукциональный pRB (Campisi, d’Adda di Fagagna, 2007). Еще один известный биомаркер — это старение-ассоциированная ß-галактозидаза. В образцах кожи человека с возрастом ее экспрессия увеличивается как в фибробластах, так и в кератиноцитах (Dimri et al., 1995). Ее накопление является результатом увеличения числа лизосом в стареющей клетке (ß-галактозидаза — лизо- сомальный фермент). В данном случае стареющие клетки олича- лись от нестареющих за счет окрашивания при рН 6. В этом случае
только старые клетки имеют достаточную активность Р-галактози- дазы для конвертирования неокрашенного субстрата в синий продукт расщепления (Kurz, 2004). При изучении преждевременного старения клеток, индуцированного онкогенами, были идентифицированы еще три белка, впоследствии позволившие успешно маркировать другие типы стареющих клеток: DEC1, p15 и DCR2. Их функция при старении неясна (Campisi, d’Adda di Fagagna, 2007). В дальнейшем в категорию биомаркеров могут перейти воз- растзависимые гены из категории 7 (экспрессия которых меняется при старении), что позволит оценивать физиологический возраст вне зависимости от хронологического (Rodwell et al., 2004).
Всесторонний анализ имеющихся у нас сведений позволил предложить функциональную классификацию генов продолжительности жизни.
1. «Регуляторы» продолжительности жизни — переключатели онтогенетических программ, которые отвечают за восприятие и передачу внешнесредовых сигналов, синтез, рецепцию и транс- дукцию гормонов инсулинового пути, вторичных липофильных гормонов. Большая часть из них способствует росту и размножению, но подавляет стрессоустойчивость. Некоторые, напротив, стимулируют устойчивость к стрессу (например, klotho).
2. «Медиаторы» (гены киназ, деацетилаз белков, транскрипционных факторов), под действием регуляторов осуществляющие переключение программ стрессоустойчивости в ответ на сигналы из окружающей среды (наличие пищи, перенаселение, температурный и световой режимы, облучение) или на эндогенный окислительный стресс. «Медиаторы» тканеспецифичным образом регулируют экспрессию различных эффекторых генов либо непосредственно активность или время жизни белков. Кроме того, они взаимодействуют между собой, подавляя или стимулируя эффекты друг друга.
3. «Эффекторы» продолжительности жизни — гены стрессоустойчивости (гены белков теплового шока, антиоксидантной защиты, репарации белков и ДНК, компонентов протеосомы, каль- паинов, белков автофагии, врожденного иммунитета, детоксификации ксенобиотиков, регуляторов метаболизма). В определенном смысле их можно считать генами антистарения, и их сверхэкспрессия, как правило, увеличивает продолжительность жизни. Зачастую они действуют аддитивно, активируясь под действием отдельных «медиаторов» и увеличивая продолжительность жизни в условиях стресса. Ряд «медиаторов», напротив, подавляет их активность.
4. Гены жизнеспособности — обычные гены «домашнего хозяйства» (housekeeping genes). Они функционируют повсеместно,
на всех стадиях жизненного цикла, и обеспечивают структуру клетки, биосинтез аминокислот, липидов и нуклеотидов, гликолиз, цикл трикарбоновых кислот и т. д. Их мутации либо летальны, либо ведут к патологиям. В условиях стресса некоторые из них могут временно репрессироваться под действием «медиаторов», что позволяет сэкономить ресурсы для функционирования «генов-эффекторов» и увеличить продолжительность жизни.
5. Гены, участвующие в функционировании митохондрий, — гены компонентов электронотранспортной цепи, рассопрягающих белков и ген clk-1 нематод. Эти гены регулируют энергетический метаболизм, уровень свободных радикалов, а некоторые из них — апоптоз.
6. Гены-регуляторы клеточного старения и апоптоза (p53, p21, p16, pRB). Они участвуют в предотвращении рака, в регуляции клеточного цикла и гибели ненужных или вредных клеток в раннем онтогенезе и зрелости. Их плейотропным побочным действием в старости является старение (репликативное или стресс-ин- дуцированное) делящихся клеток или избыточная убыль постмитотических клеток. Как показано на нематодах, эти гены способны неизвестным апоптознезависимым образом влиять на старение так называемых постмитотических организмов.
Таким образом, гены играют важную роль как в детерминации продолжительности жизни, так и в процессе старения. Однако это не означает обязательного присутствия в геноме локусов, непосредственно управляющих старением (наподобие эмбрионального развития). Гены могут просто очерчивать пределы, в которых организм отвечает на стресс или повреждение. Они не контролируют процесс, а детерминируют возможные ответы, задавая скорость старения. Например, если старение вызывается накоплением повреждений от токсичного агента, то гены, участвующие в детоксификации, будут играть большую роль в детерминировании продолжительности жизни, но не будут ответственны за причину процесса (Helfand, Rogina, 2003а).
Количественный признак в отличие от менделевского характеризуется градиентом фенотипов. Варьирование обусловлено влиянием нескольких различных генов, каждый из которых привносит свой небольшой вклад в исследуемый фенотип. Кроме того, многие количественные признаки подвержены влиянию внеш- несредовых и онтогенетических факторов. В результате такого взаимодействия различные генотипы могут приводить к идентичным фенотипам (Poirier, Seroude, 2005). С другой стороны, один и тот же генотип может лежать в основе различающихся фенотипов. Изучение общественных насекомых, у которых касты различаются по продолжительности жизни на порядки, продемон- 51
стрировало это со всей очевидность. Касты сильно различаются по поведению, морфологии и продолжительности жизни, что является результатом баланса между наследуемыми профилями ген - ной экспрессии и внешними рисками смертности. В онтогенезе эти различные программы запускаются эпигенетическими факторами, такими как качественный состав пищи (Rueppell et al., 2004).
Поскольку люди живут гораздо дольше модельных животных (которые к тому же умирают от ^охарактеризованных патологий и болезней), генетика продолжительности жизни человека является более сложной. Даже возрастзависимые патологии мышей и человека явно различаются (Butler et al., 2003).
Чтобы по возможности отделить «геронтогены» от генов воз- растзависимых заболеваний, геронтология человека делает основной упор в исследованиях на так называемое «обычное», или «благополучное», старение при отсутствии патологий (Weinert, Ti- miras, 2003). Наиболее плодотворным объектом исследования в связи с этим являются столетние индивидуумы. Во-первых, они обычно поддерживают хорошее здоровье до очень старого возраста, даже вне зависимости от образа жизни — столетние индивидуумы часто избавлены от сердечно-сосудистых заболеваний, болезни Альцгеймера, сахарного диабета и рака. Во-вторых, их потомки наследуют устойчивость ко многим причинам смертности — среди них на 50 % менее распространены вышеперечисленные заболевания. Вероятность наследования долгожительства в семьях долгожителей возрастает в 4—17 раз, что предполагает скорее генетические, чем внешнесредовые предпосылки к исключительному долголетию (Butler et al., 2003; Atzmon et al.,
2006) . Кровные родственники столетних индивидуумов характеризуются 4-кратным увеличением вероятности дожить до 91 года, тогда как кровные родственники 95-летних имеют в 2.3 раза больше шансов дожить до этого возраста (Schoenmaker et al., 2006).
Изучение генов чрезвычайно старых здоровых индивидуумов с точки зрения генетики старения очень плодотворно, поскольку они «насыщены» генами долгожительства и являются генетически гомогенными в большей степени, чем остальная популяция. Однако они представляют собой недостаточно большую выборку, к тому же отсутствует контрольная когорта (Karasik et al., 2005). За последние 10 лет в различных популяциях среди столетних индивидуумов неоднократно были предприняты попытки найти гены долгожительства. На данную роль у человека претендуют PON1, IGF-1, PAPR-1 и гены цитокинов, ферментов антиоксидантной защиты (Sod) и компонентов метаболизма липидов. Среди лиц в возрасте 90—100 лет и старше (т. е. столетних индивидуумов) особо выделяются три генотипа: аллели гена CETP (CETP VV) и гена аполипопротеина C3 (APOC-3 CC) и делеция в гене адипо- нектина (ADIPOQ). Важно отметить, что APOC-3 находится под транскрипционным контролем FOXO-1, ортологи которого контролируют долгожительство у всех генетических моделей (Martin et al., 2007). Для столетних индивидуумов характерны крупные липопротеиновые частицы и большое количество липопротеинов высокой плотности (Atzmon et al., 2006). В отличие от тех, кто не доживает до 90 лет, они сохраняют чувствительность к инсулину и устойчивость к оксидативному стрессу (Cheng et al., 2005).
Чтобы обойти проблемы, связанные с исследованием долгожителей, для изучения был предложен альтернативный фенотип — биологический («физиологический», «функциональный») возраст. Поскольку ткани стареют с разной скоростью, а болезни варьируют от индивидуума к индивидууму, люди с возрастом все больше различаются. В результате хронологический возраст не способен быть точным индикатором процесса старения. Биологический возраст имеет выраженный генетический компонент (27—57 %) и позволяет сравнивать функциональный статус одного индивидуума с другим того же хронологического возраста и в результате такого сопоставления делать выводы о различии в скорости старения (Karasik et al., 2005). Вариация фенотипа биологического возраста во многом определяется аддитивными генетическими факторами (наследственность составляет 0.57 ± 0.06) и в меньшей степени — средовыми. Она обусловлена локусами количественных признаков на хромосомах 3p, 7q, 11p, 16q и 21q (Karasik et al., 2005).
Наиболее обещающие гены-кандидаты межиндивидуальных отличий по биологическому возрасту у человека участвуют в регуляции кровяного давления и метаболизма липидов, определяют функциональные регуляторной оси гормона роста/инсулина/рос- товых факторов, регулируют процессы воспаления, метилирования ДНК, эпигенетического подавления генов (в том числе генов ДНК-геликаз и экзонуклеаз). Кроме того, сюда относятся гены антиоксидантных ферментов (Sod1 и Sod2), гены стресс-ответа, факторы поддержания теломер. Ряд исследований посвящен потенциальной роли в регуляции продолжительности жизни аполипопротеина A1 (APOA-I), аполипопротеина C3 (APOC-III), аполипопротеина A4 (APOA-IV), ингибитора активатора плазминогена типа I (PAI-1) и SHC-трансформирующего белка (SHC1) (Karasik et al., 2005).
Исследования близнецов показали, что примерно 25 % вариации продолжительности жизни человека объясняется гене-53
тическими факторами (Schoenmaker et al., 2006). Для оценки вклада генов в варьирование продолжительности жизни человеческой популяции в будущем потребуются крупномасштабные исследования методом случай-контроля. При этом большое количество аллелей генов продолжительности жизни, соответствующих модификациям всех функциональных модулей таких генов, будут проанализированы на все возможные вариации последовательности и сопоставлены с детальной информацией о фенотипе каждого индивидуума за продолжительный период времени. Это позволит вскрыть генетические факторы, вносящие вклад в каждое отдельное проявление старения человека (Vijg, Suh, 2005).
С точки зрения генетики продолжительности жизни и старения, перспективными задачами являются поиск биомаркеров старения, негенетических методов вмешательства в процессы старения (лекарств), генетических механизмов их действия и SNP (полиморфизмов одиночных генов долгожительства и возраст- зависимых заболеваний), а также анализ механизмов внешне- средового влияния (калорийности пищи и др.) и дальнейшие исследования в области сравнительной биологии старения (Butler et al., 2003).
Еще по теме Генетика продолжительности жизни:
- Йога и продолжительность жизни.
- Продолжительный вдох / Продолжительный выдох
- Продолжительность голодания сокращать не надо
- Продолжительный вдох / Нормальный выдох
- Нормальный вдох / Продолжительный выдох
- КАК УВЕЛИЧИТЬ ПРОДОЛЖИТЕЛЬНОСТЬ И РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ГРУДНОГО ВСКАРМЛИВАНИЯ
- КАК УВЕЛИЧИТЬ ПРОДОЛЖИТЕЛЬНОСТЬ И РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ГРУДНОГО ВСКАРМЛИВАНИЯ
- "Случай 1. Продолжительное ухудшение, ведущее к смерти."
- Грудное вскармливание: начало, продолжительность и практика исключительно грудного вскармливания
- Грудное вскармливание: начало, продолжительность и практика исключительно грудного вскармливания
- ЧУВСТВО ЖИЗНИ
- РАДОСТЬ ЖИЗНИ
- Первая наука жизни
- Этапы человеческой жизни