Генетическая нестабильность. Постоянство генома и старение
В процессе старения первыми выходят из строя те системы, чье поддержание энергозатратно, а повреждение необратимо. Среди них особое место занимает поддержание постоянства генома.
Энергия, требуемая для распознавания повреждений и репарации ДНК десятками различных ферментов, огромна, а износ генома часто невосполним. В результате генетическая нестабильность является одной из главных причин старения всех эукари-отов. Непостоянство генома — одна из ведущих проблем в молекулярной генетике (Хесин, 1984). Его эффекты могут иметь раз- 117
личные проявления, включая дестабилизацию хромосом, обмены сестринских хроматид и анеуплоидию, мутации и амплификацию генов, клональную гетерогенность, отсроченную репродуктивную и апоптотическую гибель клетки (delayed apoptosis), неопластическую трансформацию (Limoli et al., 1998).
От дрожжей до человека возрастзависимая генетическая нестабильность может иметь разнообразные проявления: потеря ри- босомальной ДНК, дестабилизация теломер и увеличение количества хромосомных перестроек.
Так, у человека определенные мутации ферментов репарации ДНК, например Ercc2 (Xpd), Хгсс5 (Ки86) и Wm, связанные с нарушением стабильности генома, приводят к частичным прогериям (Nikitin et al., 1997; Carter et al., 2005; Kujoth et al., 2005). Однако прежде всего нестабильность генома приводит к изменению генной экспрессии и, таким образом, к возрастным нарушениям в клеточной физиологии. Действительно, долгожительство у дрожжей, Caenorhabditis elegans и дрозофил можно вызвать увеличением активности деацетилазы гистонов, вовлеченной в хроматиновый сайленсинг — подавление экспрессии генов (см. разд. 3.3).Как и любое биологическое явление, нестабильность генома, а вернее, механизмы, лежащие в ее основе, могут иметь и важное позитивное значение в жизни клетки.
Достаточно вспомнить в связи с этим соматический гипермутагенез при формировании сродства антител. В то же время нарушение контроля стабильности может привести к накоплению мутаций или эпигенетических изменений, что в свою очередь ведет к патологии — канцерогенезу или старению (Зайнуллин, Москалев, 2000). Таким образом, также как и клеточное старение и апоптоз, механизм генетической нестабильности по отношению к старению организма может быть антагонистически плейотропным.Предполагаемых причин возникновения возрастзависимой нестабильности генома может быть несколько: наличие комплексов двухцепочечных разрывов ДНК, укорочение теломер, активация мобильных генетических элементов и снижение эффективности функционирования процессов репарации (Зайнуллин, Москалев, 2000). В свою очередь нестабильности генома противостоят мощные эшелоны клеточной защиты. «Гены-уборщики» (caretaker) в норме предотвращают повреждения ДНК. Они увеличивают стабильность генома, снижая риск рака и отсрочивая старение. Деле- ция этих генов, напротив, вызывает синдромы ускоренного старения (см. разд. 2.2.2). «Гены-контролеры» (gatekeeper), ответственные за гибель клетки и задержку клеточного цикла в ответ на повреждение ДНК, включают в себя классические супрессоры опухолей, напримерр53 (см. разд. 2.2.3). Они часто инактиви
руются посредством мутаций или эпигенетического сайленсинга при возникновении различных типов рака. Усиление функции супрессоров опухолей, напротив, подавляет пролиферацию стволовых клеток, усиливает апоптоз или клеточное старение митотических клеток, опосредуя, таким образом, старение организма в целом (Papazoglu, Mills, 2007).
Дрожжи стали одним из первых объектов, продемонстрировавших роль генетической нестабильности в качестве основного механизма старения. В 80-х годах XX века Эгилмец и Джазвин- ский выдвинули гипотезу о том, что старение дрожжей происходит благодаря стохастическому появлению фактора старения, который экспоненциально накапливается, пока не убьет клетку (Egilmez, Jazwinski, 1989).
В 1997 г. Синклер и Гваренте предположили, что таким фактором может быть экстрахромосомная ДНК, образующаяся вследствие генетической нестабильности в локусе рибосомальной ДНК — RDN1, составляющем 10 % всего генома дрожжей (Sinclair, Guarente, 1997). Как оказалось, старые клетки дрожжей переполняются экстрахромосомными кольцами рДНК (до 1000 шт.), что, по-видимому, ведет к фильтрации факторов транскрипции и репликации, вызывая гибель клетки похожим на апоптоз способом (Bitterman et al., 2003).Таким образом, большинство случаев репликативного старения у дрожжей возникает из-за неспособности поддерживать целостность генома. Вышеупомянутые экстрахромосомные кольцевые рДНК являются самореплицирующимися и ассиметрично перераспределяются между материнской и дочерней клетками при митозе, что приводит к их накоплению исключительно в стареющей клетке. Эктопическое попадание таких колец в клетку уменьшает продолжительность ее жизни, тогда как генетические манипуляции, снижающие образование колец, продлевают ее жизнь (Bitterman et al., 2003; Kaeberlein et al., 2005a, 2005c). Другие типы экстрахромосомной кольцевой ДНК, например плазмида TRP1/ARS1, также могут укорачивать жизнь дрожжей (Guarente, Kenyon, 2000). Фенотипические изменения, происходящие в стареющей материнской клетке дрожжей, заключаются не только в дестабилизации локуса рДНК, но и в одновременной экспрессии генов a-и a-типов спаривания вследствие нарушения репрессии локусов HML и HMR. Гаплоидные клетки в норме экспрессируют либо а-, либо a-информацию из локуса типа спаривания MAT. Одновременная экспрессия генов обоих типов спаривания приводит к стерильности материнской клетки (репродуктивному старению) из-за неспособности при половом процессе быть правильно распознанной (Guarente, Kenyon, 2000; Bitterman et al., 2003). Как уже упоминалось в предыдущем разделе, старение дрожжей связано 119
с умолканием генов возле теломерных концов (Bitter-man et al., 2003).
В результате генетических исследований процесса старения дрожжей Saccharomyces cerevisiae было сделано заключение, что гены, вовлеченные в сайленсинг (умолкание) хроматина, могут быть ключевыми регуляторами старения.
Как уже отмечалось, сайленсинг — это процесс, в результате которого целые участки хромосом, охватывающие блоки генов, оказываются транскрип- ционно неактивными (Guarente, Kenyon, 2000). Упаковка ДНК и гистонов в «молчащий» гетерохроматин — основной механизм, посредством которого дрожжи подавляют образование экстро- хромосомной кольцевой ДНК. Наличие гетерохроматина в локусе RDN1 обусловлено активностью комплекса белков SIR2, NET1, CDC14 и NAN1 (Bitterman et al., 2003). В старых материнских клетках деацетилаза SIR2 перераспределяется с теломер и генов типа спаривания в ядрышко (Guarente et al., 1998). Причем механизм сайленсинга не предотвращает транскрипцию генов рРНК, а лишь подавляет их рекомбинацию (Bitterman et al., 2003), что является компенсаторной реакцией антистарения. В подтверждение этих слов следует отметить, что сверхэкспрессия SIR2 увеличивает репликативную продолжительность жизни. Еще одна гистоновая деацетилаза — RPD3 деацетилирует гистон H4. У дрожжей она необходима для начала репликации и регуляции рДНК; кроме того, она подавляет транскрипцию генов. Мутация в гене rpd3 ведет к гиперацетилированию гистонов, но в отличие от SIR2 это приводит к умолканию всех трех локусов генетической нестабильности стареющей клетки дрожжей (локуса типа спаривания, теломер и рДНК). В итоге мутация в гене rpd3 значительно увеличивает продолжительность жизни клеток дрожжей (Bitterman et al., 2003).Ген продолжительности жизни дрожжей fobl кодирует ядерный белок, необходимый для блокирования репликационной вилки ДНК непосредственно в точках ее начала, расположенных в рДНК, что способствует возможности рекомбинации. Линии с де- лецией fobl имеют в 100 раз более низкий уровень рДНК-реком- бинации и несут меньше кольцевых экстрахромосомных ДНК. Такие мутанты живут в 2 раза дольше линий дикого типа (Bitterman et al., 2003).
АТФ-зависимая геликаза Sgs1p семейства RecQ участвует в репликации, рекомбинации и в формировании проверочной точки S-фазы дрожжей (Azam et al., 2006), взаимодействуя с топоизоме- разами II и III (Guarente, 1996; Sinclair et al., 1998).
Мутанты ^^/Охарактеризуются снижением средней продолжительности жизни. По одной из моделей, это происходит благодаря гиперрекомбина-120ции рДНК, приводящей к появлению экстрахромосомных колец, накапливающихся в материнской клетке и вызывающих ее гибель. Однако ряд наблюдений противоречит этой точке зрения. Например, преждевременного накопления колец рДНК не было обнаружено как у sgsl-мутантов, так и при нарушении гомологичной рекомбинации в результате мутаций других генов репарации (RAD50, RAD51, RAD52 и RAD57). Более того, у клеток, выведенных из состояния стационарной фазы, продолжительность жизни снижается без появления кольцевых рДНК. Некоторые случаи, при которых длительность жизни дрожжевой клетки увеличивается (например, ретроградный ответ при сигналинге из митохондрий в ядро), также сопровождаются экспоненциальным накоплением кольцевых рДНК. Таким образом, накопление экстрахромосомных рДНК не является непосредственной причиной репликативного старения. По-видимому, мутация гена sgsl имеет более глубокие последствия, приводя к систематическим эндогенным повреждениям ДНК и хромосомным перестройкам, т. е. к нестабильности генома (Hoopes et al., 2002).
Другая репликативная геликаза/нуклеаза дрожжей — DNA2, также являющаяся членом семейства RecQ-геликаз, необходима для нормальной продолжительности жизни. У мутантов dna2 все фенотипы, присущие старым клеткам (удлинение клеточного цикла, возрастзависимые дефекты транскрипционного сайленсинга, реорганизация ядрышка), возникают спустя лишь несколько поколений. Однако продолжительность их жизни можно увеличить экспрессией дополнительной копии sir2 или делецией fobl. Мутация rad27S в гене гомолога нуклеазы FEN-1 млекопитающих, участвующей в поддержании геномной стабильности, также приводит к преждевременному старению дрожжей (Hoopes et al., 2002). Более того, сверхэкспрессия RAD27 подавляет эффекты мутации dna2-1. Таким образом, SGS1, DNA2, RAD27 и FOB1 взаимодействуют в процессе поддержания стабильности генома и репликативного старения у дрожжей (Lesur, Campbell, 2004).
В настоящий момент все исследователи сходятся во мнении, что наиболее вероятным фактором, способствующим возникновению рекомбинаций и ускоренного старения у мутантов дрожжей, является повреждение ДНК при репликации. При нормальном старении вероятной причиной репликационных ошибок следует считать эндогенное оксидативное повреждение ДНК. В итоге возникает генетическая нестабильность — экстрахромосомные кольцевые ДНК или потеря гетерозиготности, что обусловливает репликативное старение (Hoopes et al., 2002; Lesur, Campbell, 2004).
Вышеперечисленные механизмы эволюционно консервативны. Потеря ортолога RecQ5 у нематоды также вызывает появление чувствительности к повреждению ДНК и укорочение продолжительности жизни (McColl et al., 2005). Мутации генов некоторых геликаз млекопитающих служат причиной частичных прогерий (см. разд. 2.2.2). Частичная потеря функции гена деацетилазы грйЗ у дрозофилы увеличивает продолжительность жизни (Bitterman et al., 2003). У млекопитающих один из гомологов деацетилазы SIR2 дрожжей — SIRT6 принимает участие в эксцизионной репарации оснований и поддерживает целостность генома клетки. Его потеря у мышей сопровождается старение-ассоциированным дегенеративным синдромом (Mostoslavsky et al., 2006).
У мышей мутанты, потерявшие функцию супрессора опухолей BRCA1, характеризуются высокой эмбриональной летальностью, а также задержкой роста, апоптозом, дефектами репарации ДНК, амплификацией центромер, потерей проверочной точки G2/M клеточного цикла, геномной нестабильностью. Около 40 % наследственного рака груди связано с мутацией гена Brcal. В то же время отсутствие полнофункционального Brcal приводит к клеточному старению у мутантных эмбрионов и клеток в культурах, а также к преждевременному старению взрослых мышей. Преждевременное старение мышей проявляется в виде снижения продолжительности жизни, уменьшения отложения жира, остеопороза, атрофии кожи, ослабления заживления ран. Нарушение функции BRCA1 активизирует р53, что отчасти объясняет наблюдаемые фенотипы. Эффекты, вызванные отсутствием Brcal, могут быть отменены потерей самого р53 или его гена-мишени p21. Мутантные клетки, избежавшие старения, подвергаются клональной селекции на быструю пролиферацию, у них наблюдаются молекулярные изменения, такие как сверхэкспрессия циклина Б1и циклина А, а также потеря p53, что приводит к опухолеобразованию (Cao et al., 2003).
Таким образом, очевидно, что гены, играющие определяющую роль в поддержании стабильности генома, регулируют продолжительность жизни не только клеток дрожжей, но и млекопитающих. Данные механизмы являются эволюционно консервативными.
Исследования, выполеннные на мутантных клетках и организмах, лишь продемонстрировали возможную роль генетической нестабильности в старении. Каков главный механизм генетической нестабильности при естественном старении? Жизнеспособность организма обеспечивают мощные процессы самоподдержания и репарации. Например, в каждой клетке человека за день происходит 30—70 тыс. повреждений ДНК. Возникает необходимость в значительных энерготратах на производство ферментов репарации (Wright, Shay, 2005а). В молодых клетках спонтанные повреж - дения ДНК и их репарация сбалансированы. С возрастом снижается способность к репарации и повреждения накапливаются, вследствие чего и возникает генетическая нестабильность (Wojda, Witt, 2003).
Наиболее опасным типом повреждения ДНК являются двухцепочечные разрывы. При этом нарушаются сразу обе матрицы, а такое повреждение часто летально для клетки, поскольку восстановление требует сближения гомологичных хромосом и огромных энерготрат. Двухцепочечные разрывы ДНК происходят в клетке в результате оксидативного энергетического метаболизма, мейоза, репликации ДНК и У(Б),|-рекомбинации. Кроме того, они возникают вследствие облучения и других внешних генотоксических воздействий (Espejel et al., 2004). Наконец, в качестве двухцепочечного разрыва воспринимаются критически укороченные и лишенные покрова белков теломеры. Если повреждение ДНК не ре- парируется в относительно короткий промежуток времени (несколько дней), то клетки подвергаются стресс-индуцированному преждевременному старению либо апоптозу (Naka et al., 2004).
Эукариотические клетки имеют два пути репарации двухцепочечных разрывов — гомологичную рекомбинацию и негомологичное соединение концов. Последний способ наиболее важен и осуществляется ДНК-зависимой протеинкиназой и комплексом ХКСС4/лигазы IV. ДНК-протеинкиназа состоит из гетеродимера Ku86/Ku70 и каталитической субъединицы. Гетеродимер Ku связывается с концами поврежденной ДНК, предотвращая их деградацию и стимулируя репарацию. Было показано, что клетки, дефектные по Ku86 и каталитической субъединице ДНК-зави- симой протеинкиназы, проявляют хромосомную нестабильность. Нокаутных мышей по любому из трех компонентов ДНК-протеин- киназного комплекса отличают иммунодифицит и повышенная радиочувствительность. Трансгенные мыши с нарушенной каталитической субъединицей характеризуются низкой продолжительностью жизни и ранним началом связанных со старением патологий по сравнению с животными дикого типа. У них заметно повышается вероятность случаев Т-лимфом и инфекций. Все это можно объяснить с позиции участия каталитической субъединицы ДНК-протеинкиназы в репарации ДНК и поддержании длины теломер (Morgan et al., 1997; Espejel et al., 2004; McColl et al., 2005).
Таким образом, вполне вероятно, что накопление повреждений ДНК с возрастом может быть связано с наблюдаемым снижением уровня аутоантигенов Ku (Ku70 и Ku86), ДНК-зависимой протеинкиназы и PARP (Salminen et al., 1997). Исследование изменения с возрастом уровня экспрессии белков репарации двухцепочечных разрывов Ku70, Mre11, Sir2, TRF1 и Ku80 в лимфоцитах показало заметное снижение лишь Ku70 и Mre11. Кроме того, экспрессия Ku70 выше у долгожителей (Ju et al., 2006). В гепатоцитах
пожилых крыс удаление УФ-индуцируемых повреждений в активно транскрибируемых участках генома ниже по сравнению с молодыми животными, что предполагает снижение с возрастом в ядре репарации, связанной с транскрипцией (Souza-Pinto et al., 1999). Дефекты репарации и, как следствие, повреждение ДНК могут обусловливать старение путем снижения количества функциональных стволовых клеток. Такие нарушения для гематопоэтических клеток наблюдаются у мышей с дефектами генов репарации (Atr, FANCD1, MSH2, ERCC1, Ku80, XPD, mTERC) или с гипомор- фной аллелью ДНК-лигазы IV. Мыши с мутацией фермента репарации RAD50, входящего в состав MREll-комплекса, проявляют гипоплазию костного мозга. При нормальном старении гематопоэтические стволовые клетки характеризуются также проявлениями повреждения ДНК (под микроскопом обнаруживаются скопления гистона H2AX). Несмотря на то что такие стволовые клетки не прекращают пролиферировать, они часто подвергаются апоптозу (Sharpless, DePinho, 2007).
Одним из возможных проявлений нестабильности является возрастзависимое изменение экспрессии генов. Транскрипционный профиль фронтального кортекса человека при старении демонстрирует начало изменения транскрипции ряда генов уже после 40 лет. Причем уровень повреждений ДНК (накопление 8-ок- согуанина) наиболее заметно увеличивается в промоторах именно тех генов, экспрессия которых снижается с возрастом. Промоторные участки генов особенно уязвимы, так как они содержат GC-богатые последовательности, которые очень чувствительны к оксидативному повреждению и не защищены репарацией, связанной с транскрипцией. Таким образом, большее количество исходных повреждений и более медленная эксцизионная репарация оснований отдельных промоторов могут вносить вклад в окси- дативное повреждение генов, приводя к снижению их экспрессии и к дисфункции клеток. Увеличение оксидативного повреждения ДНК в стареющем кортексе сопровождается сверхэкспрессией ферментов эксцизионной репарации 8-оксогуанин-ДНК-гли- козилазы и урацил-ДНК-гликозилазы (Lu et al., 2004). Кроме того, в постмитотическом мозгу в 1.5—2 раза усиливается активность ферментов эксцизионной репарации гликозилаз NEIL1 и NEIL2, тогда как уровень мРНК других гликозилаз, например OGG1 и APE1, снижается (Englander, Ma, 2006). Таким образом, при старении имеет место воспроизводимое подавление активности одних генов (в результате нарушений в их промоторах или в рамках адаптивного ответа) при компенсаторной активации других.
Теория соматических мутаций выдвигает на роль главной причины старения накопление устойчивых нарушений генов в сома- 124 тических клетках, а в качестве важнейшего их источника рассматривает свободные радикалы (Weinert, Timiras, 2003). Действительно, изменения в генетическом материале на уровне генов и хромосом в соматических и половых клетках почти всегда вредные, снижающие приспособленность и здоровье организма. Например, большинство рецессивных мутаций, даже в гетерозиготе, снижает приспособленность у дрозофилы на 1—2 %, причем такие мутации синергетически взаимодействуют, что усугубляет их вред. Накопление генов с отсроченными эффектами увеличивает генетическую нестабильность соматических клеток. С возрастом в клетках организма увеличивается число генных мутаций, событий хромосомных разрывов, транспозиций ДНК, изменений пар оснований микро- и минисателлитных повторов, окислительных повреждений ДНК, нерасхождений хромосом, повреждений митохондриальной ДНК. Одновременно происходит снижение способности репарировать ДНК, эффективности ДНК-полимеразы и уровня рекомбинации, а также количества ловушек свободных радикалов и длины теломер. Теория соматических мутаций подтверждается и тем, что агенты, индуцирующие мутации или повышающие скорость мутирования, также снижают продолжительность жизни (химические и физические мутагены, стрессы, дефекты антиоксидантной защиты, подавление функции опухолесупрессоров) (Woodruff, Thompson, 2003).
Приведем несколько примеров, подтверждающих теорию соматических мутаций. С возрастом увеличивается количество клеток, которые накапливают хромосомные аберрации в результате нарушения репарации в С2-фазе клеточного цикла. В ряде исследований было показано возрастзависимое увеличение хромосомных потерь — гипоплоидии (преимущественно половых хромосом, Х-хромосомы у женщин и Y — у мужчин) и анеуплоидии в периферических лимфоцитах и фибробластах кожи. Кроме того, FISH-анализ интерфазных ядер у человека показал значительное увеличение с возрастом доли анеуплоидных клеток с потерянными аутосомами 1, 4, 6, 8, 10 и 15. Многие из этих хромосом несут гены продолжительности жизни или синдромов преждевременного старения. Вполне возможно, что степень и тип анеуплоидии могут обусловливать влияние дозы таких генов на контроль клеточной пролиферации при старении. Частота анеуплоидии напрямую связана с образованием микроядер. Дисфункции кине- тохоры и центромеры способны вызывать отставание целых хромосом или хромосомных фрагментов в анафазе. В результате в телофазе формируются микроядра, обнаруживаемые в цитоплазме дочерних клеток как малые дополнительные ядра. Этот процесс усиливается с возрастом. В результате клетки пожилых инди- 125
видуумов содержат в 3 раза больше микроядер, чем клетки молодых. В то же время такие клетки редко способны долго поддерживать свою жизнеспособность. Стабильные цитогенетические повреждения накапливаются с возрастом в значительно большей степени: транслокации и инсерции возрастают 10-кратно, другие хромосомные нарушения — дицентрики и ацентрики с возрастом учащаются 3-кратно (Wojda, Witt, 2003). Среди соматических мутаций, происходящих в результате стохастических событий и принимающих участие в старении клеток, выделяют также ретротранспозиции элемента LINE-1 (long interspersed nuclear element- 1), точечные мутации в микроРНК, сегментные дупликации и неполное доминирование (гаплонедостаточность) (Martin, 2005).
У противников теории соматических мутаций также есть свои аргументы. Например, несмотря на то что рентгеновское облучение снижает продолжительность жизни гаплоидных ос (Habrobra- con) больше, чем диплоидных, нормальная продолжительность жизни этих двух разновидностей ос одинакова. Это якобы доказывает несущественную роль мутированных соматических генов в старении. Однако у гаплоидных особей во многих тканях отмечены экстрахромосомы, дублирующие важную информацию (полиплоидия) (Woodruff, Thompson, 2003), что не позволяет делать столь глобальные выводы из данного эксперимента.
Согласно теории накопления соматических мутаций, клонирование особей с использованием ядер старых клеток должно вести к снижению продолжительности жизни по сравнению с использованием ядер более молодых клеток (Woodruff, Thompson, 2003). Действительно, мыши и сельскохозяйственные животные, клонированные из соматических клеток, часто имеют сниженную продолжительность жизни и большинство таких животных нездоровы — подвержены пневмониям и нарушениям функции печени (Kato et al., 1998; Ogonuki et al., 2002). Тем не менее в одном из экспериментов мыши, клонировавшиеся путем переноса соматического ядра в течение шести поколений, не проявляли признаков преждевременного старения, оцениваемого по поведенческим параметрам (Wakayama et al, 2000). Возможно, это связано с тем, что у мышей отсутствует репликативное старение. Как обсуждалось в предыдущем разделе, модель клонированных животных дает противоречивые результаты и при оценке роли укорочения теломер в старении организма.
Старение также сопровождается глобальным эпигенетическим сдвигом. Исследование возраст-ассоциированной активации эпигенетически подавляемых генов в тканях стареющих мышей показало, что их на 2 порядка больше, чем соматических мутаций.
Известен сдвиг гетерогенности клеточных популяций в тканях млекопитающих при старении (Martin, 2005). Современная молекулярная генетика указывает на два класса возрастзависимых эпигенетических изменений: метилирование цитозина в CpG-динуклеотидах и ковалентная модификация ДНК-связанных гистонов, в особенности ацетилирование и метилирование. Метилирование цитозинов в CpG богатых островках промоторов генов обычно связано с подавлением активности, тогда как ацетилирование гистонов — с генной активацией (Martin, 2005). Наиболее заметным эпигенетическим изменением, сопровождающим старение, является постепенная потеря 5-метилцитозина в регуляторных участках генов и в повторяющихся последовательностях (Бердышев и др., 1967; Ванюшин, Бердышев, 1977; Oakley, Van Zant, 2007). Снижение количества 5-метилцитозина в геномной ДНК наблюдается как в стареющих культурах клеток, так и in vivo. Обработка клеточных культур ингибиторами ДНК-метилтранфераз сокращает продолжительность их жизни по сравнению с контролем. Гипометилирование ведет к фенотипическим проявлениям клеточного старения, сопровождающимся повышенной экспрессией опухолесупрессоров p1$NK4a и p21 (Sun et al., 2004).
Показано, что делеция PASG (proliferation associated SNF-2-like gene), гена геликазы SNF2-подобного фактора, способствующего метилированию ДНК, вызывает глобальное гипометилирование, задержку роста и развития и фенотип преждевременного старения. Мыши с данным дефектом отличаются низкой массой тела при рождении, быстро седеют и теряют волосы, имеют слабую прослойку подкожного жира, отличаются предрасположенностью к остеопорозу, кифозу, кахексии и преждевременной гибели. Фибробласты из эмбрионов этих мутантов проявляют фенотип репликативного старения. У них заметно выше экспрессия ассоциированного со старением гена pl6NK 4a, что связано с низкой экспрессией bmi-1 — негативного регулятора p16. Таким образом, не вызывает сомнений, что метилирование ДНК через изменение генной экспрессии задействовано в процессах старения (Sun et al.,
2004) .
Тогда как молодые монозиготные близнецы практически неотличимы по эпигенетическим маркерам, старые близнецы проявляют значительные вариации. Так, обнаружены глобальные и ло- кус-специфичные различия метилирования ДНК и ацетилирования гистонов. Различия в экспрессии генов у старых пар близнецов в 4 раза больше, чем у молодых (Martin, 2005). В норме одна из Х-хромосом в женских соматических клетках инактивирована путем гиперметилирования. С возрастом наблюдается реактивация генов в «выключенной» Х-хромосоме (Barbot et al., 2002). Возраст- 127 зависимое гипометилирование ДНК может вносить вклад в хромосомную нестабильность, вести к активации онкогенов и увеличению частоты опухолей с возрастом. Особенно велика вероятность данных событий в долгоживущих, стволовых, клетках (Oakley, Yan Zant, 2007).
Ретротранспозон IAP (intracisternal A-particle), являющийся членом большого семейства строго подавляемых мобильных элементов, активируется с возрастом. Это становится возможным благодаря деметилированию промотора данного транспозона, отмеченному, например, в печени старых мышей. Неконтролируемые перемещения IAP могут вызывать дестабилизацию генома, тем более что он представлен в геноме мышей в количестве 1000 копий. Деметилирование также необходимо для индукции эндогенных ретровирусов MuL V и MMTV у стареющих грызунов. Их инсерция вызывает различные мутации, включая активацию генов-мишеней благодаря энхансерному эффекту. Это может служить причиной эпигенетических и стохастических процессов, таких как включение или выключение различных генов, и вызывать старение клетки (Barbot et al., 2002).
Таким образом, экспоненциальное увеличение количества транспозонов в геноме может быть причиной инактивации существенных генов и приводить к гибели клеточной линии или организма в целом, т. е. транспозоны могут быть причиной старения (Murray, 1990). Корреляция между старением и активностью транспозирующихся элементов проанализирована на разнообразных биологических системах (Nikitin, Shmookler Reis, 1997).
Количество эксцизий элемента Tc1 на сайт у нематоды Caenor- habditis elegans возрастает более чем в 14 раз на протяжении жизни этого организма (Egilmez, Shmookler Reis, 1994). В регуляцию продолжительности жизни особей данного вида вовлечены транс- позаза и ретротранспозон-интеграза. Исследования показали, что транспозаза относится к числу генов, чья экспрессия увеличивается при старении, а это может приводить к геномной нестабильности (Hamilton et al., 2006). В то же время гены транспозазы высо- коэкспрессированы и у долгоживущих личинок dauer, и у мутантов daf-2, что должно приводить к общей активации транспозиций. Хотя транспозиции не сопровождаются увеличением продолжительности жизни, а скорее наоборот, у долгоживущих червей они могут быть следствием изменения структуры хроматин, например отклонения от нормы соотношения разных гистоновых белков. У имаго daf-2 уровень гистонов H2 снижен, а Н4 повышен (McEl- wee et al., 2004).
Соматически активный В-элемент значительно снижает продолжительность жизни, половую и физическую активность дрозо- 128
фил. Рекомбинации между повторяющимися последовательностями мобильных элементов в соматических клетках могут вести к перестройкам ДНК. Соматические перемещения Р-элементов у Drosophila melanogaster и тяагшег-элементов у D. simulans значительно снижают продолжительность жизни самцов. У D. melanogaster происходит лог-линейное снижение продолжительности жизни с увеличением количества активных Р-элементов. Перемещение даже одного соматически активного Р- или mariner-элемента приводит к значительному снижению продолжительности жизни (Woodruff, 1992; Woodruff, Nikitin, 1995; Woodruff et al., 1999). Транспозоны могут участвовать в процессе старения через соматические мутации. Установлено, что по крайней мере два ретротранспозона у дрозофилы (Copia и 412) имеют соматическую активность во взрослых тканях (Driver, McKechnie, 1992). Кроме того, для Copia показано значительное повышение с возрастом уровня транспозиций в гаметах (Filatov, Morozova, 1998). Таким образом, индукцию транспозиций можно считать одной из причин возрастной нестабильности генома и клеточного старения.
Таким образом, старение связано со снижением способности поддерживать и репарировать геном соматических клеток. Дестабилизация генома, накопление соматических мутаций и эпигенетических изменений могут обусловливать изменение экспрессии генов, являющееся причиной возрастзависимого нарушения клеточных функций. Кроме того, нестабильность генома может служить причиной увеличения частоты возникновения рака с возрастом.
Еще по теме Генетическая нестабильность. Постоянство генома и старение:
- «СТАРЕНИЕ» КОЛЛАГЕНА - УНИВЕРСАЛЬНЫЙ МЕХАНИЗМ СТАРЕНИЯ СТРУКТУР ОРГАНИЗМА, ИЗМЕНЯЮЩИХ СВОЮ ДЛИНУ.
- Постоянство аюрведы
- 4. Принцип «Постоянство»
- БарановВ.С.. Генетический паспорт — основа индивидуальной и предиктивной медицины / Под ред. В. С. Баранова. — СПб.: Изд-во Н-Л,2009. — 528 с.: ил., 2009
- Нестабильная стенокардия
- Особые генетические формы
- ГЛАВА 6 ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ В ИММУНОЛОГИИ
- Нестабильность позвоночно-двигательного сегмента
- Нестабильность позвоночно-двигательного сегмента
- Москалев А. А.. Старение и гены. — СПб.: Наука,2008. — 358 с., 2008
- Инфаркт миокарда и его разновидности. Нестабильная стенокардия